В 1993 году Правительством региона перед Калининградским техническим институтом рыбной промышленности и хозяйства была поставлена задача подготовки специалистов для строительной, энергетической и нефтегазовой отраслей.

И уже в 1993 году в составе факультета судостроения и энергетики было организовано инженерно-строительное отделение под руководством к.т.н., доцента Сафронова Георгия Александровича.

В 1994 году Калининградский технический институт рыбной промышленности и хозяйства (КТИРПиХ) был преобразован в Калининградский государственный технический университет (КГТУ).

В 1996 году была организована кафедра строительства, теплогазоснабжения и вентиляция, которую возглавил к.т.н., доцент Сафронов Г.А. Первый выпуск по двум специальностям "Промышленное и гражданское строительство" (ПГС) и "Теплогазоснабжение и вентиляция" (ТГВ) был осуществлен в 1998 году.

В 2008 году руководством университета было принято решение разделить кафедру строительства, теплогазоснабжения и вентиляции на две кафедры: кафедру "Промышленное и гражданское строительство", которую возглавил д.т.н., профессор Вальт Артур Брунович, и кафедру "Теплогазоснабжение и вентиляция", которую возглавил д.т.н., профессор Герасимов Анатолий Алексеевич.

В 2015 году решением Ученого совета КГТУ был образован и начал свою деятельность строительный факультет, в состав которого вошли кафедры "Промышленное и гражданское строительство" и "Теплогазоснабжение и вентиляция". Строительный факультет возглавил к.т.н., доцент Пименов Валерий Александрович.

В 2021 году в КГТУ в связи упразднением факультетов были образованы институты. Кафедры "Промышленное и гражданское строительство" и "Теплогазоснабжение и вентиляция" были объединены в кафедру строительства, которая и по настоящее время находится в составе института морских технологий, энергетики и строительства.